Οι βιολόγοι έχουν επιλέξει 31 πηγές άνθρακα που χρησιμοποιούνται συνήθως για την ανάλυση των μικροβιακών κοινοτήτων, σε μια διεθνή μελέτη για την οικολογική ποικιλομορφία των μικροβιακών λειτουργιών.ΠερισσότεροΈνας από τους τυπικούς και εξουσιοδοτημένους τρόπους. Κάθε κομμάτι.96 τρύπες ECOΥπάρχουν 3 ομάδες παράλληλων στο πίνακα, κάθε ομάδα 31 πηγές άνθρακα, 3 αρνητικοί ελέγχοι, μετά την προσθήκη του ίδιου δείγματος, μπορούν να ληφθούν 3 ομάδες παράλληλων δεδομένων. Η μικροβιακή κοινότητα χαρακτηρίζει αυτές τις 31 πηγές άνθρακα χρησιμοποιώντας ένα μεταβολικό χάρτη δακτυλικών αποτυπωμάτων που ονομάζεται αυτή η μικροβιακή κοινότητα. Από ένα χάρτη δακτυλικών αποτυπωμάτων σε ένα μεμονωμένο μικροπλακέτο μπορείτε να πάρετε πολλές μεταβολικές πληροφορίες. Μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τη μελέτη της λειτουργικής μικροβιολογικής ποικιλομορφίας σε καθαρές και μεικτές μικροβιακές ομάδες (π.χ. δείγματα εδάφους).

Η εταιρεία BIOLOG των ΗΠΑ έχει σχεδιάσει ειδικά για την ανάλυση των μικροβιακών κοινοτήτων και την οικολογική έρευνα και περιέχει 31 πηγές άνθρακα που χρησιμοποιούνται συχνά από διεθνείς μικροβιολόγους εδάφους για την ανάλυση των μικροβιακών κοινοτήτων.

Κάθε πλάκα 96 οπών ECO έχει 3 ομάδες παράλληλων, κάθε ομάδα 31 πηγές άνθρακα, 3 αρνητικούς ελέγχους, μετά την προσθήκη του ίδιου δείγματος, μπορούν να ληφθούν 3 ομάδες παράλληλων δεδομένων. Η μικροβιακή κοινότητα χαρακτηρίζει αυτές τις 31 πηγές άνθρακα χρησιμοποιώντας ένα μεταβολικό χάρτη δακτυλικών αποτυπωμάτων που ονομάζεται αυτή η μικροβιακή κοινότητα. Από ένα χάρτη δακτυλικών αποτυπωμάτων σε ένα μεμονωμένο μικροπλακέτο μπορείτε να πάρετε πολλές μεταβολικές πληροφορίες. Μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τη μελέτη της λειτουργικής μικροβιολογικής ποικιλομορφίας σε καθαρές και μεικτές μικροβιακές ομάδες (π.χ. δείγματα εδάφους).

Οι 31 πηγές άνθρακα μπορούν να χωριστούν σε έξι κατηγορίες, όπως εξής:

Μονόγλυκοσίδες/γλυκοζίδες/πολυμερισμένες ζάχαρες

Β2, D-ξύλινη ζάχαρη

H1, α-D-λακτόζη

A2, ?-μεθυλο-D-γλυκοζίνη

G2, Φωσφορική γλυκόζη-1

E1, α-δακτυλική παστερίνη

F1, Ηπατική ζάχαρη

G1, D-διαζάχαρη

αμινοξέα,

A4, L-αργινίνη,

Β4, L-σπαρταμινικό οξύ

C4 L-φαινυλαλανίνη

D4, L-σερίνη

E4, L-Σουρίνη

F4， Γλυκινίνη-L-γλουταμίνη

Εστερικά

B1, Ακτονικό μεθυλικό εστέρα

C1, Τουέιν 40

D1, Τουίν 80

A3, D-ημι-λακτοξικός γυμναϊκός εστέρας

Αλκοόλη

C2, Ι-αλγογλυκόλη

D2, D-γανλουόλη

H2, D, L-α-γλυκερίνη

Αμινικά

G4, Φινυλοαιθυλαμίνη

H4, αμίνη

E2, N-ακετυλ-D-βιταμίνη

Οξέα

Β3, D-ημι-λακτοζικό οξύ

F2 D- Αμινογλυκοξύ

C3, 2-υδροξυβενζονικό οξύ

D3, 4-Υδροξυβενζονικό οξύ

E3, r-υδροξυλυτρικό οξύ

F3, Λικωνικό οξύ

G3, α-μπουντονικό οξύ

H3, D-μήλιο οξύ

Μετά την απλή επεξεργασία του δείγματος (φιλτράρισμα ή κεντρική κέντρωση), η λήψη του υγρού προστίθεται στην καλλιέργεια ECO για έως και 5 ημέρες, σε ορισμένες περιόδους χρησιμοποιώντας το ένζυμο κλίμακα σε 590nm και 750nm για να μετρηθεί η τιμή OD, το μέγεθος της τιμής OD αντιδράσει το δείγμα μικροοργανισμός χρησιμοποιεί τη δυνατότητα ενός συγκεκριμένου υποβάθρου πηγής άνθρακα, εξάγει την τιμή OD μετά την ανάλυση, όπως η τιμή AWCD (μέση απορρόφηση), ο πλούτος, η δυναμική ανάλυση μιας τρύπας, η σύγκριση διαφορετικών πηγών άνθρακα κλπ

Αξίζει να σημειωθεί ότι η πλάκα ECO δεν μετρά μόνο τα καλλιεργήσιμα μικρόβια, αλλά και μερικά μη καλλιεργήσιμα μικρόβια, εφόσον τα μικρόβια μπορούν να χρησιμοποιήσουν την πηγή άνθρακα για τον μεταβολισμό (και δεν αναπαράγονται), το σύστημα χρωματισμού της πλάκας ECO μπορεί να ανιχνευθεί.

Οι πιο συνηθισμένες εφαρμογές είναι η ανάλυση των περιβαλλοντικών παραγόντων, των ριζικών συστημάτων, των φύλλων, των λιπασμάτων και των φυτοφαρμάκων στην οικολογική ποικιλομορφία των μικροβιακών γονιδίων του εδάφους, η σύγκριση των διαφορών λειτουργικής ποικιλομορφίας μεταξύ διαφορετικών δειγμάτων ή του ίδιου δείγματος σε διαφορετικές χρονικές στιγμές, η σύγκριση των διαφορών λειτουργικής ποικιλομορφίας των μικροβιακών κοινοτήτων πριν και μετά την αποκατάσταση του περι